Спустя столетие страна была провозглашена республикой, рабство было отменено. Капоэйра из поселений бывших рабов перебралась в города и превратилась из сугубо африканского искусства в достояние всего местного населения. Для многих бедняков она служила преступным оружием для выживания. В результате началось отождествление этого танца с чем-то незаконным, капоэйра была объявлена социальной болезнью. В начале 19 столетия был издан указ о борьбе с капоэйристами.
Но африканское боевое искусство не исчезла. Широкое распространение оно получило в портовых городах, где постоянно происходило скопление моряков и солдат-наемников из разных стран. Благодаря многочисленным дракам, техника капоэйра обогатилась ударами и движениями из боевых искусств других стран. Капоэйристы стали использовать лезвия и палки.
Истинное искусство боевого танца было скрыто от непосвященных. Мастера капоэйра, собираясь в секретных местах, старались поддержать древние традиции. Они развивали не только техническую составляющую, но и философский аспект танца-боя, пели древние песни, играли на простейших национальных инструментах.
Военный переворот 1930 года изменил политическую ситуацию в Бразилии. Гонения на капоэйра ослабли. Вскоре открылась первая официальная школа боевого искусства. Ее основателем был Мануэль дус Рейш Машаду - мастер Бимба. Его усилиями было выстроено доступное, четкое и дисциплинированное учение «Режиунал». Бимба легализовал капоэйра как национальный вид борьбы. Он систематизировал существующую технику и обогатил ее новыми движениями.
Известность и народную популярность завоевал также мастер Паштинья. Его стиль называется «Ангола», в честь страны, откуда привозили рабов. Эти два мастера считаются ключевыми фигурами, которые определили развитие современной капоэйра. Бимба отдавал приоритет боевым аспектам, а Паштинья подчеркивал традиционно ритуальный и игровой характер боевого танца.
Первый серьезный интерес к этому боевому искусству в России был проявлен в 1994 году, после выхода фильма «Только сильнейшие». В 1998 году Госкомспорт зарегистрировал «Федерацию капоэйра России».