В 998 году поэтесса вышла замуж за столичного дворянина Фудзивара Нобутака. Для дочери чиновника средней руки это был выгодный союз, учитывая даже тот факт, что супруг был старше ее на двадцать лет и содержал еще трех жен. В 999 году Мурасаки родила дочь, которая в будущем также стала поэтессой, известной как Дайни-но Саммисю.
После смерти мужа в 1001 Мурасаки осталась практически без средств к существованию и была вынуждена поступить на службу к императрице Сеси. Одновременно с Мурасаки в число придворных дам вошли две другие знаменитые поэтессы: Идзуми Сикибу и Акадзоме Эмон. Это был блистательный двор, при котором часто устраивались поэтические турниры.
Роман «Гэндзи моногатари» был написан в период с 1001 по 1008 год. Это одно из крупнейших произведений японской классической литературы, которое многие современные исследователи считают первым в мире психологическим романом. В основе произведения – эротическая биография Гэндзи, незаконнорожденного императорского сына. Произведение состоит из множества новелл, каждая из которых представляет собой отдельное любовное приключение японского Дон Жуана.
«Дневник Мурасаки Сикибу», датируемый 1008-1010 гг., относится к жанру дзуйхицу - коротким записям о том, что волновало писательницу в то или иное время. «Дневник» в основном рассказывает о повседневной жизни и интригах императорского двора, но есть в нем и отдельные детские воспоминания. Предположительно в 1013 году было составлено личное собрание стихов Мурасаки, включившее в себя 126 стихотворений-танка.